根据规划，基地主要任务是建设海峡西岸区域研发中心，将其打造为以企业为主体的联合研发中心、构建行业共性技术服务平台、建设企业创新支撑平台、构筑两岸研发机构集中区；以高新技术产业、先进制造业、现代服务业和现代农业为重点，成为率先突破制约两岸科技合作交流体制机制障碍的先行先试基地，成为海峡西岸经济区与台湾经济全面对接的前沿平台；至2015年，引进、孵化台资企业、台湾学者创业企业500家，新增工业产值1000亿元以上；吸引台湾企业或高校院所来厦设立研发机构50家，吸纳或建立10家台资科技创业风险投资企业；引入台湾人才培训机构10家、创新团队100支、各类专业技术人才1000名。
为促进闽台科技合作与交流向更深层次和更高水平发展，繁荣海峡西岸经济区发展，发挥科技支撑和引领作用，厦门市政府近年投入大量资金先后建成厦门火炬（翔安）产业区、软件产业基地、集美机械工业区和同安工业集中区四大高新技术产业发展园区。在这些工业产业园区内，已聚集了相当规模的台商企业和台湾科技创业者。（记者张建琛）
